Philippe Choquard est élève de W. Pauli à l'EPFZ où il obtient sa thèse de doctorat en physique théorique sur un sujet de mécanique quantique semi-classique. En 1954, il devient membre de l'Institut Battelle à Genève où il collabore à de nombreux projets de recherches industrielles et où il crée notamment un groupe de physique théorique et mathématique. De 1964 à 1967, il est professeur invité à l'Université d'Illinois et au Troisième cycle de la physique en Suisse romande. En 1968, il est nommé par appel professeur à l'EPUL/EPFL. Il y crée et dirige l'Institut de physique théorique jusqu'en 1980. Son enseignement et sa recherche portent sur la physique du solide, la mécanique statistique des milieux ionisés, l'expérimentation numérique et la mécanique analytique. Il a pris sa retraite en 1995.